在免疫学方面的文献中,流式图是标配,现在总结一下文章中流式图的排版。
第一个案例[1]:
不同样本不同时间点的流式图,这是放在正文中的流式图,排列如下所示:
此图特点:
所有样本的中使用的相同marker,都使用一个,放在一个大坐标中,坐标并没有使用流式细胞仪自带的软件或者是Flowjo标记的标签,图是经过了AI或PS编辑;
上端是时间标签;
右端是样本标签;
左端与下端是markers标签。
第二个案例[2]:
在这个图中,使用了不同的门亚划分亚类,使用箭头来标明亚群的流式图,如下所示:
此图特点:
细胞的marker,也就是横纵坐标轴没有使用流式细胞仪自带的软件或Flowjo进行编辑,图是经过了PS或AI的编辑;
如果B亚群在A亚群里面,使用箭头进行标记。
如果是单染的话,通常是使用峰图来表示,还是此篇文献,如下所示:
此图特点:单染通常使用峰图表示,使用不同的颜色来标记不同的样本。
第三个案例[3]
:
在这个案例中,有四组,其中一组是对照,剩下三组用同一个因素去干预,可以使用横线来表示,如下所示:
此图特点:
对照组放左图,实验组放右边;
实验组使用相同的条件进行干预,要使用横线进行标明;
相同的markers可以统一使用,不同在每张流式中进行标明,而是使用AI或PS进行统一编辑。
第四个案例[4]
:
此图特点:
某个亚群的亚群,使用箭头来标明;
不同的样本来源,在每张图式图的上面进行标注;
右边的两张图是使用了同型对照;
通常情况下,首选使用FSC/SSC来划分亚群,不过有的情况下,也有人直接放出目标细胞的亚群,看下面的案例。
第五个案例[5]
:
此图特点:并没有使用FSC/SSC来进行第一个亚群的划分,原因我猜可能是由于排版的问题,直接放出最关键的亚群即可。小图的右边是对每个亚群进行定量。
现在总结如下:
一、
在进行不同的亚群划分时,通常是先SSC/FSC进行画门,严格情况下,有人还会使用DAPI来区分死细胞,然后再在该门中进行目标细胞亚群的划分。
二、
从流式细胞仪中直接拷出来的流式图,或者是经Flowjo编辑过的流式图通常无法直接放在文章中,需要放在AI或PS中进行进一步的编辑与排版,例如每个样本的流式图不必都标记上marker,把相同的marker直接使用一个大的坐标系,每张流式图的上方或右侧放上样本名称。
三、 如果样本多,需要进行统计时,还要放上统计结果。
四、
在进行流式图的排版时,不同的markers直接写上就行,荧光染料通常不用标记,例如在使用F4/80-PE对细胞进行染色时,最终坐标上只用写上F4/80即可,不用写上F4/80-PE。
参考文献
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3.
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